2018年7月，他被指控於在1971年於紐約性侵了一名16歲男童，因而被迫辭去樞機主教職位。而儘管麥克卡里克宣稱他“完全不記得”此事，但經紐約教區查核後，發現這一指控“可信且證據確鑿”，進而將此案移交梵蒂岡調查。

梵蒂岡此次大動作革除（或稱“還俗”，仍然可以領取聖餐，但不能主持彌撒儀式或聽人告解）麥克卡里克神職，使其成為近代神職人員中遭這項懲處的最高級別人物。他將不再能擔任神父，並禁止參加聖禮，除非是替瀕死之人赦免罪行。在天主教中，比這更嚴厲的懲處只有逐出教會。

對此，紐約教區的神父費許表示：“（革除麥克卡里克神職）並沒有令我們感到滿意。但神父理應具有某種代表性，並且具備與之相伴的美德和尊嚴。也許，這麼做能讓我們逐步重拾此一目標。”

天主教教宗方濟各（Pope Francis）將召集來自全球的主教，討論如何處理令天主教會頻頻發生的對未成年人性侵醜聞。外界對這場會議普遍抱以高度期待。

梵蒂岡表示，這次會議的主要目的將是讓主教們面對這個問題。但是，麥克卡里克的解職究竟是教會新生的第一步、或是最後一步，恐怕還有待觀察。

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