隨著科瓦奇離開拜仁，外界對於其離開的原因也進行了猜測，雖然他的離開直接原因是因為拜仁客場1比5輸給法蘭克福，但實際上誰都知道，科瓦奇的下課無疑是一種長期不利因素的總爆發，這個因素最大的還是更衣室矛盾，畢竟戰績這方面按理說科瓦奇還沒有到下課的地步。

這個問題實際上之前就已經出現了。科瓦奇在以主教練身份加盟球隊不久就遭遇到球隊資深球員的反對，原因無疑是他在希望新官上任三把火，透過陣容的調整來展現自己的權威，同時讓球隊表現更好，這也觸犯了一些資深球員的利益。要不是拜仁主席赫內斯的力挺，科瓦奇很可能將下不來臺而在上個賽季就下課了。

當然科瓦奇作為主帥自身也存在問題，他並沒有從維護球隊團結的角度來和球員相處，沒有自信傾聽球員們的一件，而是完全按照自己的意志行事，希望以此來樹立在球隊的權威。比如新賽季隨著庫蒂尼奧的到來，科瓦奇直接取消了穆勒先發資格。而且每一場比賽的上場時間只有十多分鐘。這無疑引發了穆勒的強烈不滿，更讓他不滿的無疑就是科瓦奇在媒體面前表示在其他球員上不了而球隊需要穆勒的時候就會讓他首發。對於穆勒這樣的功勳球員，科瓦奇的言論無疑非常讓人反感。

此外在球隊對陣柏林聯合的比賽結束後，科瓦奇也批評球員的能力和態度都有問題，這也讓他成為了更衣室的麻煩製造者。再加上拜仁CEO對科瓦奇並不滿意，對陣法蘭克福的慘敗無疑成為了讓其下課的最好理由，赫內斯的力挺也很難將其留下。科瓦奇的經歷也充分說明，要想成功駕馭一支豪門球隊，主帥確實需要有更好的方法和策略才行。

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